이제 막 리눅스 좀 접해보는데 답변 좀 부탁드립니다

제가 회사에서 요즘 리눅스를 이용한 일을 해야되서 작업을 좀 하고 있는데요;

회사에서는 PuTTY로 ssh를 이용해서 작업을 하고 있는데, 

엄청 구체적으로 작업을 해야하는 건 아니고, 그냥 주어진 프로그램으로 이것저것 만들면 되는건데....

회사에서 ssh로 프로그램 사용할 때는 잘 됬는데


집에서 (집에서는 그냥 cygwin으로 하고 있습니다; ) 할 때는 프로그램을 인식하지 못하는거 같네요;

그냥 회사에서는 프로그램명만 입력하면 됬는데, 분명이 디렉토리도 프로그램이 있는 디렉토리인데...

command not found라고 나오거나 cannot execute binary file이라고 나오네요.

그리고 ls로 디렉토리 살펴볼 때 회사에서는 프로그램만 초록색으로 표시됬는데,

집에서해보니 그냥 다른 파일들처럼 하얀색으로 표시됩니다;

어떻게 해야 프로그램을 실행시킬 수 있을까요?;