웹프로그램을 어느 위치에 설치해야 가장 안전합니까?

쇼핑몰을 하나 만들려고 합니다
그런데 웹프로그램을 어느 위치에 설치해야 가장 안전합니까?
예를 들자면
 1. 가장상위 루드 디렉토리 위치에 설치한다
 2. Home 디렉토리를 하나 만들고 그 안에 만든다
 3. 어느 디렉토리에 만들어도 상관없다
 4. 웹전용 디렉토리가 따로 있다

고수님들의 많은 답변 부탁 드립니다

현재 나는 가장상위 루트 디렉토리에 설치하려고 합니다 밑에는 내 리눅스 루트상위 디렉토리 상태 입니다

/bin
/boot
/dev
/etc
/home          <--- 어떤 분들은 여기에 설치 하라고 하던데 맞나요?
/initrd
/lib
/lost+found
/misc
/mnt
/opt
/sbin
/web/heli/www/index.php    <- 이렇게 설치 하려고 합니다

root@heli #]