알 수없는 현상의 원인을 알고 싶어요..

안녕하세요 여러 전문가님들..
전 초보 서버관리자입니다...-_-;;

저 혼자 어찌 해보려고 3개월을 헤메다 이렇게 질문 올립니다...

제 서버의 사양은
cpu : p3-1gh
ram : 256m
이며
wowlinux 7.1 paran
을 사용하고 있습니다..
약 40개 정도의 계정이 운용되고 있는데
지난 5월경부터 이상한 현상이 발생하기 시작한 것입니다..

이상한 현상인즉

1. 일부 계정의 사이트가 브라우저로 접속이 되다 안되다 하는 것입니다..
그냥 안되는 것이 아니고
"페이지를 찾을 수 없습니다"로 나올 때
다시 새로고침을 계속하면
접속이 됩니다...
이러한 현상이 하루 24시간 중 절반 정도로 번갈아 가며 벌어지고 있습니다...ㅜ_ㅜ

2. 더욱이 이상한 것은 서버의 모든 사이트가 그런 것이 아니라
.com 도메인은 전부 접속상태가 정상이고 .net과 .co.kr 등 국내 도메인만
접속이 불량하다는 것입니다..

3. 더 기가 찰 일은 접속이 불량할 때 어디서나 안되는 것이 아니라
특정 회선(두루넷) 사용자만 안된다는 것이었습니다..
그 동안 확인한 결과 접속이 불량할 타임에는 서울, 부산, 제주, 할 것 없이 모든 두루넷
사용자들은 접속이 불량했습니다...

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이상이 간략한 문제의 요지입니다..

서버 설정이 잘못되었나 매일 매일 살펴보고 두루넷측에 수차 연락해 보았지만
해답을 찾지 못하였습니다...

대체 이러한 현상의 원인은 어디에 있을까요...
여러 전문가 님들의 의견 부탁 드립니다..
(해답은 아니어도 좋습니다.. "이렇지 않을까"라는 의견만이라도...)

그럼,
즐거운 주말 되세요~