unix 에서 linux 로 전환

안녕하세요.

제가 슈퍼 컴퓨터를 사용하고 있는데

슈퍼 컴퓨터를 관리하는 곳에서 하드웨어를 바꾸는 관계로

유닉스에서 리눅스로 바뀌게 되었는데

유닉스를 사용할때는

컴파일 시킬때 make라는 명령어를 사용하였고 실행시킬때는  ./'filename'.exe 명령어를 사용하였습니다.

예) 저의 파일 이름이 'PerFilm' --> 실행 : ./PerFilm.exe

그런데 리눅스로 바뀌면서 이 명령어들이 실행이 되지 않네요..

그리고 확장명으로 *.o 를 쓰고 있는데 이것 또한 바뀌어야 하는지 궁금합니다.

제가 완전 초보라서.. 고수님들의 답변 부탁드립니다.